Para excluir um usuário da sua empresa, primeiramente siga o caminho:

Menu Principal -> Pessoas -> Usuários

Nesta tela são listados todos os usuários que você possui cadastrados na sua empresa.

Após localizar o usuário desejado, basta clicar em "Opções" no card dele, depois selecionar o botão "Excluir" para desativar o cadastro dele na sua empresa.

Este usuário poderá ser recuperado posteriormente.

Na imagem, segue uma ilustração do passo a passo citado: